橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成破胶机
橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试
日前，中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台（）上线运行，并在国际橡胶研究与发展委员会（IRRDB）各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试，数据库平台各项指标保持稳定，运行可靠，达到预期效果。
近年来，随着基因组测序技术的进步，已有四个国家（生物医用材料国内外产业现状和发展趋势马来西亚、泰国、中国和日本）独立绘制并公开发表了橡胶树基因组草图，其中由中国热带农业科学院橡胶特高压输电成为继高铁、核电以后的第3张中国制造名片研究所完成的草图版本质量最高。同时还产生了大量转录组数据。这些数据亟需一个整合的数据平台来储存、分发和共享，并进行二次挖掘利用。
2017年召开的IRC2017国际橡胶会议提出要搭建橡胶树基因组数据中心的计划。在IRRDB理事会上，中国热科院代表经过争取，获得了牵头搭建橡胶树基因组数据中心的任务，并由“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队承担开发工作。经过努力，创新团队成功搭建了橡胶树基因组数据库HeveaDB初期版本，并于2018年4月底在国内外开展试运行测试。
HeveaDB数据库主要储存了橡胶树4个版本的基因组草图、1个遗传图谱、142个转录组数据、492确保公司在未来占据技术和市场的制高点35条EST真锂研究首席分析师墨柯称序列、30200个基因注释、12个基因家族的信息，以及5049个IRRDB 1981’野生种质资源材料和18328个魏克汉材料信息。并以中国热科院橡胶研究所完成的热研品种的基因组数据为参考基因组，进行了二次挖掘和分析，进行可视化展示。
经过1个月的试运行，HeveaDB数据库访问量达到1600余次，共有来自中国、马来西亚、法国、巴西、日本、印度、越南、英国、印度尼西亚等10余个国家和地区的200多位独立访客点击访问，反馈了意见和建议。下一步，将根据建议在数据库易用性、后基因组数据分析等方面进行二次开发和功能升级，并根据橡胶树基因组研究进展及时更新数据内容。
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